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| 訪問日 | 番号 | 名称 | 住所 | 座標 | 直近駅 |
| 国i201 | 瓜生野八幡のクスノキ群 | 宮崎市大瀬町 | |||
| 国i202 | 下野八幡宮のイチョウ | 西臼杵郡高千穂町下野 | |||
| 国i203 | 下野八幡宮のケヤキ | 西臼杵郡高千穂町下野 | |||
| 国i204 | 関の尾の甌穴 | 都城市関之尾町 | |||
| 国i205 | 宮崎神社のオオシラフジ | 宮崎市神宮二丁目 | |||
| 国i206 | 去川のイチョウ | 宮崎市去川 | |||
| 国i207 | 虚空蔵島の亜熱帯林 | 南郷町 | |||
| 国i208 | 狭野のスギ並木 | 西諸県郡高原町蒲牟田 | |||
| 国i209 | 狭野神社ブッポウソウ繁殖地 | 西諸県郡高原町蒲牟田 | |||
| 国i210 | 古江のキンモクセイ | 延岡市北浦町古江2421 | |||
| 国i211 | 五箇瀬川峡谷（高千穂峡谷） | 西臼杵郡高千穂町 | |||
| 国i212 | 幸嶋サル生息地 | 串間市大字市木 | |||
| 国i213 | 高岡の月知梅 | 宮崎市高浜 | |||
| 国i214 | 高島のビロウ自生地 | 延岡市北浦町宮野浦沖合 | |||
| 国i215 | 高鍋のクス | 児湯郡高鍋町南高鍋 | |||
| 国i216 | 甑岳針葉樹林 | えびの市 | |||
| 国i217 | 妻のクス | 西都市大字妻1 | |||
| 国i218 | 七折鍾乳洞 | 日之影町大字七折 | |||
| 国i219 | 祝子川モウソウキンメイ竹林 | 東臼杵郡北川町祝子川 | |||
| 国i220 | 上穂北のクス | 西都市大字南方 | |||
| 国i221 | 清武の大クス | 宮崎郡清武町船引7074-3 | |||
| 国i222 | 青島の隆起海床と奇形波蝕痕 | 宮崎市大字折生迫 | |||
| 特i223 | 青島亜熱帯性植物群落 | 宮崎市 | |||
| 国i224 | 石波の海岸樹林 | 串間市市木 | |||
| 国i225 | 川南湿原植物群落 | 児湯郡川南町新橋 | |||
| 国i226 | 双石山 | 宮崎市大字鏡洲 | |||
| 国i227 | 大久保の大ヒノキ | 東臼杵郡椎葉村 | |||
| 国i228 | 竹野のホルトノキ | 東諸県郡綾町竹野地区 | |||
| 国i229 | 柘の滝鍾乳洞 | 西臼杵郡高千穂町 | |||
| 国i230 | 田原のイチョウ | 高千穂町河内馬場（有藤家宅地） | |||
| 特i231 | 都井岬ソテツ自生地 | 串間市 | |||
| 国i232 | 東郷のクス | 日南市東弁分乙35 | |||
| 国i233 | 湯ノ宮の座論梅 | 児湯郡新富町新田 | |||
| 国i234 | 内海のアコウ | 宮崎市内海 | |||
| 特i235 | 内海のヤッコソウ発生地 | 宮崎市内海 | |||
| 国i236 | 八村スギ | 東臼杵郡椎葉村 | |||
| 国i237 | 岬馬およびその繁殖地 | 串間市大字大納 | |||
| 国i239 | エヒメアヤメ自生南限地帯 | 小林市南西方生駒 | |||
| 国i240 | タヌキノショクダイ自生地 | 都城市御池町 | |||
| 国i241 | カンムリウミスズメカラスバト | 門川町枇榔島・乙島 | |||
| 国i242 | ノカイドウ自生地 | えびの市（えびの高原） | |||
| 国i243 | 鵜戸ヘゴ自生北限地帯 | 日南市大字宮浦字串平3232番地口−１ | |||
| 特i244 | 内海のヤッコソウ発生地 | 宮崎市内海 | |||
| 県i2500 | ｱｶｳﾐｶﾞﾒ及びその産卵地(宮崎市) | 宮崎市佐土原町大字下田島字大炊田 | |||
| 県i2501 | 大椎葉有楽椿 | 西都市大字尾八重394、395 | |||
| 県i2502 | 市木のナギ | 美郷町北郷区宇納間小原地区八重 | |||
| 県i2503 | 松尾のイチョウ | 椎葉村松尾383 | |||
| 県i2504 | 樅木尾有楽椿 | 西都市大字尾八重612、615 | |||
| 県i2505 | 福寿草自生地 | 高千穂町向山 | |||
| 県i2506 | ｱｶｳﾐｶﾞﾒおよびその産卵地（高鍋町） | 高鍋町堀の内 下永谷〜堀の内海岸 | |||
| 県i2507 | ｱｶｳﾐｶﾞﾒ及びその産卵地（新富町） | 新富町 | |||
| 県i2508 | ｱｶｳﾐｶﾞﾒ及びその産卵地（日南市） | 日南市風田・平山海岸 | |||
| 県i2509 | オニバス自生地 | 木城町大字椎木字柳丸3584 | |||
| 県i2510 | 天林寺のオハツキイチョウ | 宮崎市新別府町麓４１８ 天林寺 | |||
| 県i2511 | 山田のイチョウ | 都城市山田町山田字山菅6658 | |||
| 県i2512 | 森永の化石群 | 国富町森永永井の迫3086ほか | |||
| 2015/9/3 | 県i2513 | 権現崎の照葉樹林 | 日向市大字幸脇字千鳥4-1、6-1、6-2、7-2、7-3 | E131.37.16.1N32.20.10.6 | 美々津 |
| 県i2514 | 浄専寺シダレザクラ | 五ヶ瀬町大字三ヶ所字宮之原 | |||
| 県i2515 | 白岩山石灰岩峰植物群落 | 五ヶ瀬町 | |||
| 県i2516 | 綾のイチイガシ | 綾町大字北俣2610-4 | |||
| 県i2517 | 門川のウスギモクセイ | 門川町小松 | |||
| 県i2518 | 飫肥のウスギモクセイ | 日南市大字吉野方字山本 | |||
| 県i2519 | 飯野のイチョウ | えびの市大字原田3453 | |||
| 県i2520 | 鵜戸千畳敷奇岩 | 日南市大字宮浦字串平地先 | |||
| 串間市i238串 | 勿体岡のスダジイ林 | 串間市大字西方字宮園8612の乙 | |||
| 宮崎市i2a00 | 生目神社のオガタマノキ | 宮崎市生目347番地 生目神社 | |||
| 宮崎市i2a01 | 生目神社のクスノキ | 宮崎市生目347番地 生目神社 | |||
| 宮崎市i2a02 | 倉岡小学校のシロバナフジ | 宮崎市糸原538番地 倉岡小学校 | |||
| 宮崎市i2a03 | はぜ馬場のはぜ並木 | 宮崎市佐土原町下田島新城・佐賀利 | |||
| 宮崎市i2a04 | 名木いちょう | 宮崎市田野町乙３３１１ | |||
| 宮崎市i2a05 | ヤマザクラ（天神） | 宮崎市田野町乙３００-14 | |||
| 宮崎市i2a06 | 島津忠国の誕生杉 | 宮崎市高岡町小山田麓940-2 | |||
| 日向市i2a07 | ｱｶｳﾐｶﾞﾒ及びその産卵地お倉ヶ浜 | 日向市お倉ケ浜 | |||
| 日向市i2a08 | ｱｶｳﾐｶﾞﾒ及びその産卵地金が浜 | 日向市金ケ浜 | |||
| 日向市i2a09 | ハナガガシ | 日向市東郷町山陰乙 福瀬神社 | |||
| 日向市i2a10 | エノキ | 日向市東郷町山陰甲 水谷神社 | |||
| 日向市i2a11 | イチョウ | 日向市東郷町山陰丁 深瀬薬師堂 | |||
| 日向市i2a12 | クスノキ | 日向市東郷町坪谷 坪谷神社 | |||
| 日向市i2a13 | 冠岳の山桜群 | 日向市東郷町山陰丙・丁冠岳北壁の自然林 | |||
| 高千穂町i2a14 | 秩父杉 | 高千穂三田井 高千穂神社 | |||
| 高千穂町i2a15 | 古代イチョウ | 高千穂町岩戸 天岩戸神社 | |||
| 高千穂町i2a16 | 芝原轟口のアスナロ | 高千穂町押方４６９２−２ | |||
| 高千穂町i2a17 | クマガイソウ自生地 | 高千穂町押方 | |||
| 日南市i2a18 | 猪八重滝群 | 日南市北郷町猪八重 | |||
| 日南市i2a19 | 八幡神社境内のクス | 日南市飫肥１０丁目３番 | |||
| 日南市i2a20 | 松永のシイ | 日南市松永３４９９ | |||
| 日南市i2a21 | 願成就寺のモクセイ | 日南市今町１-５-３５ | |||
| えびの市i2a22 | 香取神社なぎ大樹 | えびの市今西区 | |||
| えびの市i2a23 | 永田家のイヌマキ大樹 | えびの市西長江浦区 | |||
| えびの市i2a24 | 荒神堂タブ大樹 | えびの市京町区 | |||
| 門川町i2a25 | 庵川路頭 | 門川町 | |||
| 串間市i2a26 | 稲荷神社のクス | 串間市崎田 | |||
| 串間市i2a27 | 市木神社のタブ | 串間市市木 | |||
| 串間市i2a28 | 市木神社のナギ | 串間市市木 | |||
| 串間市i2a29 | 串間神社のクス | 串間市大字串間1410 | |||
| 串間市i2a30 | 串間神社のスギ | 串間市大字串間1410 | |||
| 串間市i2a31 | 瀧山神社のイチョウ | 串間市大字大納 | |||
| 串間市i2a32 | 瀧山神社のスギ | 串間市大字大納 | |||
| 串間市i2a33 | 如意寺のイチョウ | 串間市西方 | |||
| 串間市i2a34 | 福島小学校のクス | 串間市西方４１４８ | |||
| 串間市i2a35 | 福島高校のケヤキ群 | 串間市西方４０１５ | |||
| 串間市i2a36 | 本城神社のイチョウ | 串間市大字本城7644 | |||
| 串間市i2a37 | 本城神社のイヌマキ | 串間市大字本城7644 | |||
| 串間市i2a38 | 雪冠スギ | 串間市 | |||
| 国富町i2a39 | 稲荷のクスノキ | 国富町本庄 稲荷神社 | |||
| 五ヶ瀬町i2a40 | 三ヶ所神社さかき | 五ヶ瀬町 | |||
| 五ヶ瀬町i2a41 | 古戸野神社杉 | 五ヶ瀬町桑野内 | |||
| 五ヶ瀬町i2a42 | 古戸野神社かや | 五ヶ瀬町桑野内 | |||
| 五ヶ瀬町i2a43 | 祇園神社けやき | 五ヶ瀬町鞍岡６０６６、祇園神社 | |||
| 五ケ瀬町i2a44 | ひいらぎ | 五ケ瀬町 | |||
| 五ヶ瀬町i2a45 | しだれざくら | 五ヶ瀬町 | |||
| 小林市i2a46 | 有楽椿 | 小林市北西方１３５４-２ | |||
| 小林市i2a47 | オオヨドカワゴロモ自生地 | 小林市堤字池の平 | |||
| 小林市i2a48 | レンゲツツジ | 小林市須木鳥田町3429-17、24 | |||
| 小林市i2a49 | ケナシベニバナヤマシャクヤク | 小林市須木下田町534-37、3 | |||
| 西都市i2a50 | 尾八重一本杉 | 西都市尾八重地区から湯の片地区の峠 | |||
| 新富町i2a51 | 春日(かすが)のいちょう | 新富町大字新田の春日地区 | |||
| 延岡市i2a52 | ヤッコソウ自生地（含む椎の木） | 延岡市熊野江町 熊野江神社 | |||
| 延岡市i2a53 | 行縢のギンモクセイ | 延岡市行縢町７４１ 行縢神社 | |||
| 延岡市i2a54 | 三川内神社の桜 | 延岡市北浦町三川内 | |||
| 延岡市i2a54 | 市振神社のヤッコソウ | 延岡市北浦町市振 市振神社 | |||
| 延岡市i2a55 | 土々呂の観音滝 | 延岡市北浦町 | |||
| 日之影町i2a56 | 深角つつじ | 日之影町大字七折東深角 | |||
| 都城市i2b00 | 十輪寺の樅の木 | 都城市山之口町山之口 | |||
| 都城市i2b01 | 東霧島神社のクスノキ | 都城市高崎町東霧島 | |||
| 小林市i2b02 | 大沢津のオガタマノキ | 小林市野尻町三ヶ野山 | |||
| 綾町i2b03 | 明見神社のイチイガシ | 綾町入野（宮原） | |||
| 綾町i2b04 | 綾神社のクスノキ | 綾町南俣 | |||
| 木城町i2b05 | 比木神社のクスノキ | 木城町椎木 | |||
| 諸塚村i2b06 | 小原井のトチノキ | 諸塚村七ツ山（小原井） | |||
| 椎葉村i2b07 | 向山神社の壱の杉 | 椎葉村不土野（神興） | |||
| 美郷町i2b08 | 坂本のセンダン | 美郷町西郷区立石 | |||
| 2015/9/3 | 都農町i2c02 | 都農一の宮のクス（夫婦クス） | 都農町川北13294 都農神社 | E131.33.39.4N32.15.34.2 | 都農 |
※ リンクなしは未訪問です。直近駅に記入がないのは、自動車等で訪問。
※
座標はMapFanにより訪問後調べた値です。E:東経、N:北緯
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※特：国指定特別天然記念物、国：国指定天然記念物、県：県指定天然記念物、市：市指定天然記念物、解除：指定解除