大量調整
1. 9cmシャーレのNGMプレートを作製する(*a)。
一晩培養した大腸菌液(OP50)100 ulを培地にスプレッダーで広げ、37℃で一晩静置する。
このときシャーレの片端にブロックを置く領域を作っておく。
2. 線虫はコンタミしていないものを使用し(*b)、3cmシャーレからブロックで植え継ぐ。
線虫の成長速度や数によって適当なブロックの大きさ(1/4-1/2)を決める。
3. 20℃で餌が無くなり、F2世代のAdultが多くなるまで(2、3日)培養する(*c)。
4. 一枚のプレートあたり約3 mlのM9を入れ、駒込ピペット(ガラス製)で線虫を集める。
この操作を2、3回繰り返し、50 mlの遠沈管にすべての線虫を集める。
5. 3000 rpm、5分間遠心し(*d)、上清をアスピレーターで取り除く。
6. M9を10 ml加えて、室温で30分間静置し、線虫内の大腸菌を消化させ、上清を取り除く。
(M9中では丸1日くらいなら放置してもOK)
7. 3000 rpm、5分間遠心し(*d)、M9で線虫を2〜3回洗う。
8. 1.5 mlチューブに入れ、線虫を自然沈殿させた後、できるだけM9を除く。
このときの線虫量をwet volumeとする。
9. 線虫を50 オlずつ0.5 mlチューブに分注し、等量のバッファー(又はDDW)(*e)を加える。
さらに2x Laemmli Buf.を100 ul加え、良く混ぜた後に99℃、2分間熱処理する。
10. すぐ氷上に移し、3分間静置する。
11. サンプルに粘性がなくなるまで、30秒間のsonicationを繰り返す。
(Output 7, Ultrasonic processor(BIOMIC))
12. 15000 rpm、15分間遠心し、その上清を1x Laemmli Buf.で1/2希釈したものを3-5 オl泳動する。
希釈系列は1/2、1/4、1/8を試してみるとよい(*f)。
13. 残ったサンプルは-20℃で保存可能。
長期保存(約1ヶ月)や分解しやすい蛋白質の場合は-80℃で保存する。
*a Agarは普通の培地で使用するものでよい。3枚のNGMプレートで約50〜100
ulの野生型の線虫(wet volume)が取れる。
上記のプロトコールはプレート3枚を想定している。
*b 培養を始める前に必ずクリーンナップしておく。
*c N2の場合、約2日でfull-growthする。時期を過ぎると線虫の数が減るので、気を付けること。
卵が大量に欲しい場合は、洗浄の段階で卵がロスしやすいので、Adultから卵を取るつもりでAdultが最大になるときに線虫を集める。
*d 大型遠心機SRX-200で3000 rpm, 5分間。小型遠心機MRX-150だと1500-3000
rpm, 1分間。
強い遠心をかけると線虫が弱るので注意。またこの過程は自然沈殿でも行うことができる。
ただし室温が高いときは20℃のインキュベーター内で行うこと。
*e 蛋白質の種類による。M9でも可能。量が少ない場合は目測で量を測るか、又は重量を量り、バッファーの量を決める。
*f 原液だと蛋白質が多いため、電気泳動時の蛋白質の分離が悪くなる。
蛋白質の種類、抗体の条件によって必要量を決めること。
一匹〜数十匹からの調製
1. 3cmシャーレのNGMプレートでOP50を塗っていないものを数枚用意する。
2. 十分に増えた線虫をブロックでOP50無しのプレートに植え継ぐ。
3. 20℃で30分間培養する。
4. 0.5 mlチューブの蓋に10 ulのバッファーを入れておき、その中に線虫をピッカー(又はガラスキャピラリー)で線虫を移していく。
又は、チューブの管壁にバッファーを滴下しておき、その中へ線虫を入れていく。
5. 線虫を管壁につけないように気を付けながら、線虫を数え入れる。
バッファーと等量の2x Laemmli Buf.を加え、軽くスピンダウンし、よく混ぜる。
6. 99℃で2分間熱処理する。
7. すぐ氷上に移し、3分間静置する。
8. 30秒間、sonicationをかける(Output 7, Ultrasonic processor(BIOMIC))。
9. 15000 rpm、15分間遠心し、その上清を5 オl電気泳動する。
| Final concentration | Worm number | Buffer volume | R13 (1:5000) b | R224 (1:5000) c |
| large scale (1/2) a |
|
|
++ | +++ |
| large scale (1/4) a |
|
|
++ | ++ |
| large scale (1/8) a |
|
|
+ | + |
| 20 worms/5 ul | 80 | 10 ul | + | +++ |
| 10 worms/5 ul | 40 | 10 ul | + | +++ |
| 5 worms/5 ul | 20 | 10 ul | - | +++ |
| 2 worms/5 ul | 8 | 10 ul | - | ++ |
| 1 worms/5 ul | 4 | 10 ul | - | + |
a Preparation of large scale sample
followed as this protocol.
b Using the purified R13 antibody
(1:5000).
c Using the antiserum R224 (1:5000).
Ref:
1. Epstein, H. F. & Feizhou, L. (1995) Proteins and Protein
Assemblies. In Methods in Cell Biology. 48 Academic Press, Inc.
p.p.437-450.
文責:Dr.Hが作製したものをTが改変