ゲル板の作製
1 ゲル板(□)のガイド沿いに、DDWで湿らせたスペーサーをはめる。
2 ゲル板(凹)をしっかりとはめる。両板を立て、底面を揃える。
3 同じ強さのクリップを下の方からとめていく。ゲル板が机に垂直に立つように!
4 分離ゲルを一定の早さで静かに流し込む。ゲル板(凹)のへこんだ部分から約20mm下に来るまで。
5 1mlのイソプロパノールを分離ゲルの上に重層させる。
6 1時間後、分離ゲルが重合していればイソプロパノールを捨て、代わりにDDWを重層させる。
ゲルが完全に重合したら使用可能。2〜3時間後くらい。気候によって若干違う。
ビーカーに余った分離ゲルは置いておき、その固まり具合で判断する。
DDWを重層させ、サランラップで包んでおけば一晩置くこともできる。
分離ゲルの作製
ゲル組成(15ml:ゲル板2枚分、単位:ml)分離ゲルと濃縮ゲルはTrisの種類が違う
| 6% | 8% | 10% | 12% | 15% | |
| DDW | 7.9 | 6.9 | 5.9 | 4.9 | 3.4 |
| 30% acrylamide | 3.0 | 4.0 | 5.0 | 6.0 | 7.5 |
| 1.5M Tris (pH 8.8) | 3.8 | 3.8 | 3.8 | 3.8 | 3.8 |
| 10% SDS | 0.15 | 0.15 | 0.15 | 0.15 | 0.15 |
| 10% APS | 0.15 | 0.15 | 0.15 | 0.15 | 0.15 |
| TEMED | 0.012 | 0.009 | 0.006 | 0.006 | 0.006 |
1 20mlビーカーにスターラーバー、10mlビーカーにDDWを入れる。
2 20mlビーカーに30%アクリルアミド溶液を入れる。そのピペットで10mlビーカーからDDWを測りとる。
3 1.5M Tris、10% SDSを加えたら、スターラーで撹拌する。撹拌しながら10% APS、TEMEDの順で加える。
4 撹拌したらゲル板に流し込む。
濃縮ゲルの作製
ゲル組成(ゲル板2枚分、単位:ml)分離ゲルと濃縮ゲルはTrisの種類が違う
| 4% | |
| DDW | 4.4 |
| 30% acrylamide | 0.8 |
| 1M Tris (pH 6.8) | 0.375 |
| 10% SDS | 0.06 |
| 10% APS | 0.06 |
| TEMED | 0.006 |
1 分離ゲルと同じ要領で10mlビーカーに調製する。
2 濃縮ゲルをゲル板に流し込む前に、分離ゲルをDDWでリンスし、余分な水分は濾紙で除く。
3 濃縮ゲルをゲル板いっぱいに流し込み、DDWで湿らせたコームを差し込む。
4 ゲルが完全に重合したら使用可能。15分後くらい。気候によって若干違う。
ビーカーに余った濃縮ゲルは置いておき、その固まり具合で判断する。
5 ゆっくりとコームをはずし、ウェルの中の未重合ゲルをDDWで洗い流す。
ゲル板の泳動槽へのセット
1 ピンセットでスペーサーをはずす(先にクリップをはずさないこと! ゲル板がずれる)
2 クリップを下からはずし、下層に1x running buf (used)を入れた泳動槽にセットし、クリップでとめる。
bufがゲルよりも上に来ることを確認。ゲル板(凹)が内側であることを確認。
3 上層に1x running buf (new)を、ゲルが全部浸るまで流し込む。
ゲル板の下部に泡があれば注射器などで取り除く。
4 サンプルをアプライする。
サンプルはアプライする前に軽くソニケーションを行うとなおよい。
水溶性であれば、12,000rpmで1〜10分間遠心し、上澄みをアプライすれば綺麗な結果が得られる。
5 コードをつなぎ、ゲル1枚につき30mAで泳動する。青いラインが下から5mmに来るまで泳動。
泳動時間は40〜70分。気候によって時間は変わる。分子量によっても最適な時間は変わる。
ゲル1枚につき20mAで流すと、時間はかかるが分離能はよくなる。
後片付け
1 使用したゲル板はすぐに水につける(ゲルがこびりつく)
中性洗剤を付けたスポンジで洗う。落としたり、他のゲル板とぶつけて割れやすいので注意。
2 充分にすすぎ、DDWでリンスした後、イソプロパノールでリンスする。
3 ゲル板立てに立てて乾燥させる。
文責:H女史が作製したものをTが改変