フロッピーの起動ディスクを入れてから電源スイッチを入れます。するとフロッピーから立ち上がり、処理が始まっていろんな表示が出てます。
しばらくすると、Windows９８のときは、Microsoft Windows 98 Startup Menu が出てます。
1.は「ＣＤ-ＲＯＭ装置を使えるようにします」、2.は「ＣＤ-ＲＯＭ装置を使いません」、3.は「ヘルプを見ます」です。そのままにしていると３０秒で1.が自動で選択されます。普通は1.を選択しておきましょう。
次に出てくるのは「キーボードは何を使っていますか？」です。
普通は日本語106キーボードですから、左上あたりにある「半角／全角（漢字）」のキーを押します。
また、しばらくいろんな表示が出てますが黙って見ていましょう（＾-＾）。
最後に「Ａ：￥＞」と出たら、そこに「ｆｄｉｓｋ」と入れてＥＮＴＥＲを押します（Ｗｉｎｄｏｗｓ98のときは起動ディスクの１枚目に入れ替えてから）。
これは、Ａドライブ（フロッピーディスク）の中に入っている「ｆｄｉｓｋ.ｅｘｅ」というプログラムを起動させるという意味です。
すると、Ｗｉｎｄｏｗｓ９５のＯＳＲ２以降やＷｉｎｄｏｗｓ９８の場合はこのメニューが出ます（Ｗｉｎｄｏｗｓの初期バージョンの時は次のメニューに飛びます）。
ここで「Ｙ」を選ぶとＦＡＴ３２というハードディスクの新しい区切り方法、「Ｎ」を選ぶとＦＡＴ（ＦＡＴ１６）という従来のハードディスクの区切り方法をを選んだことになります。ＦＡＴ３２のほうがハードディスクの領域を効率よく利用できるのですが、古い機種だと対応できない場合があるので、「Ｎ」を選んで従来のＦＡＴ（ＦＡＴ１６）にしておいた方が無難でしょう。
この「5.現在のハードディスクドライブを変更」はハードディスクを２つ以上繋いでいる場合にだけ出る項目です。
もし、5.が出る時は処理する方のハードディスクがどちらなのか、よく確認して作業を進めましょう。
新しく買って取り付けたハードディスクはまだ何も書きこみ準備ができていませんので「1.MS-DOS領域または論理MS-DOSドライブを作成」を選びます。
まず「1.基本ＭＳ-ＤＯＳ領域を作成」を選びます。基本ＭＳ-ＤＯＳ領域を作成しないで拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域を作成することはできません。
ハードディスクをひとつのパーテーションで使う時はすべての部分を基本ＭＳ-ＤＯＳ領域にしてしまえばいいのですが、ＦＡＴ（ＦＡＴ１６）では最大容量が２０４７ＭＢまでという制限があるので、それ以上の容量のハードディスクを使う場合はどうしても分けて（パーテーションを切って）使うことになります。
そこで、「Ｎ」を選び２０４７ＭＢを割り当てます。
なお、ＦＡＴ（ＦＡＴ１６）を選んでいる時は「Ｙ」にしても強制的に２０４７ＭＢが割り当てられます。
では、ここでちょっと横道にそれて、どのように領域を確保するのか概念図をご覧ください。
基本ＭＳ-ＤＯＳ領域はＣドライブになり、Ｗｉｎｄｏｗｓはここにインストールされます。
拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域はその中をいくつかに分けて複数の論理ＭＳ-ＤＯＳ領域を作ることができます。もちろん一つでも構いません。
たとえば２つに分けるとＤドライブとＥドライブになります（ただし、２台以上のハードディスクがあり接続がスレーブになると、Ｃ・Ｄ・Ｅの表示はずれることがあります）。
ここでは４．３ＧＢのハードディスクの例です。もう少し小さく設定しても構いませんが、ここでは指示される通り２０４７と入力しＥＮＴＥＲを押します。
基本ＭＳ-ＤＯＳ領域ができましたので、次に拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域を作ります。ただし、その前にひとつ作業があります。
Ｅｓｃキーを押すと先ほどのメニュー画面に戻ります。
基本ＭＳ-ＤＯＳ領域はできましたが、パーテーションを２つ以上に分けた時はＯＳ（Windows）が起動できるようするに「アクティブな領域」が設定されていないと警告が出ます。警告を無視して拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域の作成に進むこともできますが、その都度警告がでますので、ここでアクティブな領域を設定しておきましょう。
「2.アクティブな領域を設定」を選びます。
「1」を入力してＥＮＴＥＲを押します。
このとき、状態が「Ａ」になっていることを確認します。
Ｅｓｃキーを押すと先ほどのメニュー画面に戻ります。
また「1.MS-DOS領域または論理MS-DOSドライブを作成」を選びます。
今度は「2.拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域を作成」を選びます。
ここでは残りの領域すべてを拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域にします。そうしないと使えない領域が残ってしまいます。
表示されている数字のままＥＮＴＥＲを押します。
拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域が作成されましたので、次はその中に論理ＭＳ-ＤＯＳ領域を作成します。
Ｅｓｃキーを押すと自動で論理ＭＳ-ＤＯＳ領域を作成メニュー画面に移ります。
ここで、よく見ると拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域は２０４７ＭＢの制限を越えています。
そのままですと一つが２０４７ＭＢ、もう一つがわずかな残り２４ＭＢの２つのパーテーションになってしまって使いづらくなりますので、残りがもう少し大きくなるような容量に設定してみましょう。大きさはいくらでもいいのですが、今回は１７００ＭＢと残りの（約）３７０ＭＢ分けてみます。
なお、ハードディスクの容量が３．２Ｇなどで拡張ＭＳ-ＤＯＳ領域が２０４７ＭＢの制限以内なら、そのまま１つの領域にしてしまっても構いません。
では、１７００と入力してＥＮＴＥＲを押します。
１７００と入力したのに１７０２と表示されました。
入力値と表示値は一致しません。１Ｍを1048576バイトとするか便宜上1000000として計算するかで誤差が出るためです。
では、残りを表示されているままの３６９でＥＮＴＥＲを押します。
これで、領域の設定は完了しました。
Ｅｓｃキーを押します。
またメニューに戻りますがもう終わりです。
Ｅｓｃキーを押します。
Ｃｔｒｌ ＋ Ａｌｔ ＋ Ｄｅｌｅｔｅを押して再起動します。
またフロッピーから立ち上がり、Ａ：￥＞が出ます。
次はフォーマット作業に移ります。