Supraregnum ARCHAEOZOA 原真核生物上界
phyrum 15. Archaeoamoeba 原アメーバ門
phyrum 16. Metamonada 原鞭毛虫門(仮称)
subphyrum 1. Retortamonada ハラヒゲムシ亜門
subphyrum 2. Axostylata 多鞭毛虫亜門
phyrum 17. Microspora 微胞子虫門
supraregnum EUCARYOTA 真核生物上界
●Subregnum 1.
supraphyrum SARCOMASTIGOPHORA 肉質鞭毛虫上門
phyrum 18. Mastigophora 鞭毛虫門
(subphyrum 1. Zoomastigophorea Calkins,1909)
subphyrum 2. Opalinata オパリナ亜門
phyrum 19. Euglenobionta ミドリムシ門
subphyrum 1. Pseudociliata
subphyrum 2. Kinetoplastidea キネトプラスト亜門
subphyrum 3. Euglenidea ミドリムシ亜門
phyrum 20. Sarcodina 肉質虫門
subphyrum 1. Rhizopoda 根足虫亜門
subphyrum 2. Actinopoda 有軸仮足虫亜門
divisio 21. Mixomicota 変形菌門
subdivisio 1. Heterolobosa
subdivisio 2. Mixomicotina 変形菌亜門
supraphyrum Alveplata
phyrum 22. Apicomplexa アピコンプレクサ門
phyrum 23. Ciliophora 繊毛虫門
divisio 24. Dinoflagellata 渦鞭毛藻門 (Pyrrophyta 橙藻)
●Subregnum 2. SPOROZOA
phyrum 25. Ascetospora アセトスポラ門
●Subregnum 3. MYXOZOA
phyrum 26. Myxozoa ミクソゾア門
●Subregnum 4. RHODOPHYTA
divisio 27. Rhodophyta 紅藻門
subdivisio 1. Acritarchs アクリタルカ亜門
subdivisio 2. Rhodophytina 紅藻亜門