シナリオの流れ
ジョウト編

ワカバタウン ウツギ博士の家へ行きヒノアラシ、ワニノコ、チコリータのうち１匹を貰う ２９番道路を通ってヨシノシティへ ヨシノシティ あんないじいさんからマップカードを貰う ３０番道路にあるポケモンじいさんの家にいきポケモンのタマゴとポケモン図鑑を貰う ヨシノシティから２９番道路に向かうときにライバル登場、バトル 最初にもらったポケモンによって相手のポケモンが異なる（レベルは全て５） ヒノアラシ→ワニノコ ワニノコ→チコリータ チコリータ→ヒノアラシ ワカバタウン ウツギ博士の家へ行きタマゴを渡す ２９番道路を通ってヨシノシティ、３０、３１番道路を通ってキキョウシティへ

キキョウシティ マダツボミの塔 ３階まで行きバトルに勝ち秘伝マシン０５（フラッシュ）を貰う キキョウジム ジムリーダー　ハヤト 使用ポケモン：ポッポＬｖ７、ピジョンＬｖ９ 勝つとウィングバッジとわざマシン３１（どろかけ）が貰える ３２番道路、つながりの洞窟、３３番道路を通ってヒワダタウンへ

ヒワダタウン ガンテツの家 ガンテツと話す、その後ヤドンの井戸へ ヤドンの井戸 中にいるロケット団員を全て倒す これ以降、ガンテツにぼんぐりのみを渡すと特殊なモンスターボールを作ってもらえるようになる すみ職人の家で話を聞いたらウバメの森へ向かう 入口でライバルとバトル ヒノアラシの場合：ゴースＬｖ１２、ズバットＬｖ１４、アリゲイツＬｖ１６ ウバメの森 カモネギをスタート地点近くの職人の方へ誘導する 成功すると秘伝マシン０１（いあいぎり）が貰える ヒワダジム ジムリーダー　ツクシ 使用ポケモン：トランセルＬｖ１４、コクーンＬｖ１４、ストライクＬｖ１６ 勝つとインセクトバッジとわざマシン４９（れんぞくぎり）が貰える ウバメの森を抜けてコガネシティへ

コガネシティ 自転車屋 宣伝を引き受けて自転車を借りる（その後電話がかかってきて正式に貰える） コガネジム ジムリーダー　アカネ 使用ポケモン：ピッピＬｖ１８、ミルタンクＬｖ２０ 勝つとレギュラーバッジとわざマシン４５（メロメロ）が貰える ラジオ塔 クイズに５問全問正解するとラジオカードが貰える（正解するまで何回でも挑戦できる） アカネに勝った後でジムの右にある家に行くとゼニガメじょうろが貰える 道を塞いでいる変な動く木にゼニガメじょうろで水をかけるとウソッキーとバトルになり勝てば（ゲットすれば）道が通れるようになる ウソッキーをどけた後に近くのおじさんに話すと技マシン０８（いわくだき）が貰える ３４、３５、３６、３７番道路を通ってエンジュシティへ

エンジュシティ 焼けた塔 入口でライバルとバトル ヒノアラシの場合：ゴーストＬｖ２０、ズバットＬｖ２０、コイルＬｖ２０、アリゲイツＬｖ２２ ポケモンセンター マサキと会う、このイベントを見た次の日からタイムカプセルが使えるようになる ジムの右の家で質問に「はい」と答えるとダウジングマシンを貰える 踊り場 まいこはん５人全てに勝ったあとおじさんに話すと秘伝マシン０３（なみのり）が貰える エンジュジム ジムリーダー　マツバ 使用ポケモン：ゴースＬｖ２１、ゴーストＬｖ２１、ゴーストＬｖ２３、ゲンガーＬｖ２５ 勝つとファントムバッジとわざマシン３０（シャドーボール）が貰える ３８、３９番道路を通ってアサギシティへ

アサギシティ ふなのりから秘伝マシン０４（かいりき）をもらう 灯台 ミカンと話す ４０、４１番水路を通ってタンバシティへ タンバシティ 薬屋でひでんのくすりを貰う タンバジム ジムリーダー　シジマ 使用ポケモン：オコリザルＬｖ２７、ニョロボンＬｖ３０ 勝つとショックバッジとわざマシン０１（ばくれつパンチ）をもらえる ジムの前の女の子 シジマに勝った後に話すとひでんマシン０２（そらをとぶ）をもらえる アサギシティヘ戻る アサギシティ 灯台 ミカンに薬を届ける、これでミカンがジムに戻る アサギジム ジムリーダー　ミカン 使用ポケモン：コイルＬｖ３０、コイルＬｖ３０、ハガネールＬｖ３５ 勝つとスチールバッジとわざマシン２３（アイアンテール）がもらえる ４２番道路を通ってチョウジタウンへ

チョウジタウン ４３番道路を通って怒りの湖へ 怒りの湖 湖にいる赤いギャラドスを倒す ワタルとの会話のあとでチョウジタウンへ戻る チョウジタウン ロケット団のアジト 壊滅させるとワタルからひでんマシン０６（うずしお）がもらえる チョウジジム ジムリーダー　ヤナギ 使用ポケモン：パウワウＬｖ２７、ジュゴンＬｖ２９、イノムーＬｖ３１ 勝つとアイスバッジとわざマシン１６（こごえるかぜ）をもらえる ヤナギに勝ってジムを出るとウツギ博士から電話、ラジオがおかしくなる コガネシティヘ戻る コガネシティ ラジオ塔 ５Ｆでちかのかぎを入手 地下道 対ライバル戦 ヒノアラシの場合：ゴルバットＬｖ３０、ニューラＬｖ３２、コイルＬｖ２８、ゴーストＬｖ３０、オーダイルＬｖ３２ 局長にカードキーをもらう ラジオ塔 ３Ｆでカードキーを使い扉を開ける ５Ｆで幹部を倒す 局長からにじいろのはね(金の場合)、ぎんいろのはね(銀の場合）をもらう この時点でラジオ放送が元に戻る チョウジタウンへ

チョウジタウン ４４番道路を通って氷の抜け道へ 氷の抜け道 １Ｆでひでんマシン０７を入手 通り抜けてフスベシティヘ フスベシティ フスベジム ジムリーダー　イブキ 使用ポケモン：ハクリューＬｖ３７、ハクリューＬｖ３７、ハクリューＬｖ３７、キングドラＬｖ４０ 勝つと龍の洞穴へ行くように言われる 龍の洞穴 りゅうのきばを取るとイブキからライジングバッジとわざマシン２４(りゅうのいぶき)をもらえる 龍の洞穴から出るとウツギ博士から電話 ワカバタウンへ ワカバタウン ウツギ博士からマスターボールをもらう 街の右側でなみのり、トージョウの滝を抜けてチャンピオンロードへ チャンピオンロード 対ライバル戦 ヒノアラシの場合：ニューラＬｖ３４、ゴルバットＬｖ３６、レアコイルＬｖ３４、ゴーストＬｖ３５、ユンゲラーＬｖ３５、オーダイルＬｖ３８ チャンピオンロードを抜けてセキエイ高原へ

セキエイ高原 四天王戦 イツキ 使用ポケモン：ネイティオＬｖ４０、ルージュラＬｖ４１、ヤドランＬｖ４１、ナッシーＬｖ４１、ネイティオＬｖ４２ キョウ 使用ポケモン：アリアドスＬｖ４０、モルフォンＬｖ４１，フォレトスＬｖ４２、ベトベトンＬｖ４２、クロバットＬｖ４４ シバ 使用ポケモン：カポエラーＬｖ４２、イワークＬｖ４３、サワムラーＬｖ４２、エビワラーＬｖ４２、カイリキーＬｖ４６ カリン 使用ポケモン：ブラッキーＬｖ４２、ゲンガーＬｖ４５、ラフレシアＬｖ４２、ヤミカラスＬｖ４４、ヘルガーＬｖ４７ 対チャンピオン戦 ワタル 使用ポケモン：ギャラドスＬｖ４４、リザードンＬｖ４６、プテラＬｖ４６、カイリューＬｖ４７、カイリューＬｖ４７、カイリューＬｖ５０ ワタルに勝つとジョウト編クリア♪