ルイージが使える
レギュラー戦「アドベンチャー」のキノコ王国を、クリアタイムの末尾「2」でクリアする。ルイージが出現するので、1分以内に倒す。そのままアドベンチャーをクリアするとルイージとの再戦になるので、これにも勝つ。隠しキャラのルイージが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を800回以上やれば使えるようになる。

マルスが使える
最初から使える14キャラ全員を、レギュラー戦か大乱闘の対戦ゲーム、またはスペシャル乱闘で1回でも遊ぶ。隠しキャラのマルスが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を400回以上やれば使えるようになる。

ピチューが使える
イベント戦LV.37「伝説のポケモンたち」をクリアする。隠しキャラのピチューが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を200回以上やれば使えるようになる。

ガノンドロフが使える
イベント戦LV.29「トライフォース集結」をクリアする。隠しキャラのガノンドロフが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を600回以上やれば使えるようになる。

プリンが使える
レギュラー戦を1回クリアする。隠しキャラのプリンが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を50回以上やれば使えるようになる。

ドクターマリオが使える
マリオを使って、レギュラー戦をノーコンティニュークリアする。隠しキャラのドクターマリオが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を100回以上やれば使えるようになる。

ファルコが使える
どのキャラを使ってもいいので、百人組み手をクリアする。隠しキャラのファルコが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を300回以上やれば使えるようになる。

ミュウツーが使える
対戦で遊んだ時間の合計を、20時間以上にする。隠しキャラのミュウツーが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を700回以上やれば使えるようになる。

ロイが使える
)マルスでレギュラー戦をノーコンティニュークリアする。隠しキャラのロイが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を900回以上やれば使えるようになる。

こどもリンクが使える
10人以上のキャラで、レギュラー戦をクリアする。隠しキャラのこどもリンクが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を500回以上やれば使えるようになる。

Mr.ゲーム＆ウォッチが使える
Mr.ゲーム＆ウォッチ以外の全キャラで、「シンプル」、「アドベンチャー」、「ターゲットをこわせ」のどれかをクリアする。隠しキャラのMr.ゲーム＆ウォッチが使用可能になる。なお、この条件を満たさなくても、対戦ゲームの試合を1000回以上やれば使えるようになる。

オールスター戦が出現
11人の隠しキャラをすべて出現させる。レギュラー戦に隠しモード「オールスター」が追加される。25キャラ全員と戦うモードだ。

隠しステージが出現
以下の条件を満たす。隠しステージが使用可能になる。各条件と出現するステージは以下の通り。●対戦ゲームの試合を50回以上やる…ブリンスタ深部。●対戦ゲームの試合を100回以上やる…フォーサイド。●対戦ゲームの試合を150回以上やる…ビッグブルー。●対戦ゲームの試合を200回以上やる…ポケモン亜空間。●フィギュアのキャサリンをゲットする…いにしえの王国２。●Mr.ゲーム＆ウォッチでレギュラー戦をクリアする…フラットゾーン。●どのキャラでもいいから、オールスターモードをクリアする…戦場。●どのキャラでもいいから、イベント戦のLV.51をクリアする…終点。●「ターゲットをこわせ！」を25キャラ全員でクリアする…プププランド。●どのキャラでもいいから、ホームランコンテストで400m以上の記録を出す…ヨッシーアイランド。●どのキャラでもいいから、15分耐久組み手を生き残る…コンゴジャングル。

対戦待機画面にメタモンが
トーナメント乱闘で、ルールを勝ち抜けか負け抜けに設定する。出場キャラを設定したら、LとRを押しながらAを押す。対戦待機画面のキャラ表示がメタモンになる。

最初からシークで登場
大乱闘モードのキャラ選択画面でゼルダ姫を選んだら、ゲームが始まるまでずっとAを押しっぱなしにする。最初からシークに変身して登場する。

フォックスが仲間と通信
大乱闘で使用キャラにフォックスを選び、ステージを惑星コーネリアか惑星ベノムにする。試合中に十字ボタンを連打する。フォックスがペッピーやスリッピーと通信を始める。ただし、通信中はスキだらけに。

サムスの最終兵器
サムスを選んでRの投げを行う。アームが伸びきる前に「↑↓↑A」と入力すると、アームが伸びる。ただし、実際に投げるためには、相手とかさなったときにAをおす。Lを押してRをすると、誘導機能がついて、相手を追跡する。この効果は、Lを押したときから発動する。

「ターゲットをこわせ」のBGM変更
「ターゲットをこわせ！」の途中で、ポーズをかける。LかRを押しながら、Zを押す。BGMを変えられる。また、キャラ選択画面でLかRを押しながらキャラを決定しても、同じようにBGMを変更できる。

ナナを操作できる
キャラ選択画面でアイスクライマーを選ぶとき、XかYボタンでカラーを変える。4パターンのうち2パターンはポポではなくナナが操作キャラになる。性能は同じだが、声が変わる。

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