ここではアプリケーションのバックアップについての話です。
フォトショプなどのグラフィック関係のアプリケーションならでき上がった画像ファイルが何処にあるかわかっていると思います。 しかし、メールのログやブラウザのブックマークなど何処にあるかよく知らない物もあるでしょ。
でも殆どの場合インストールしたアプリケーションの中のフォルダに作られています。 と言うことは、少なくともそのフォルダを丸ごとバックアップすれば良いと言うことです。
中身を知って居られる方は、必要な部分をバックアップしてもかまいません。

バックアップ..
市販/シェア/フリーウェアのバックアップツールを使ってバックアップしても構いません。
また、MOやCD-R(/W)にコピーしてバックアップにしても良いです。
2台のパソコンをLANで繋げばバックアップ無しでも大丈夫。
ファイルを移す事が目的ですから。

これで、レジストリの情報とバックアップが揃いましたので次へ進みます。