19世紀後半、フランスはスエズ運河の建設が始まるとタジュラ湾のオ
ボック港を租借、周辺に勢力を拡大しフランス領ソマリランドとして植民地化した。
また、タジュラ湾岸に港町ジブチを開き、エチオピアのアディスアベバと結ぶ鉄道（現在のジブチ・エチオピア鉄道）が建設され
るとジブチ港の重要性は高まった。
第二次世界大戦後、アフリカ諸国の独立がすすんだが、フ
ランス領ソマリランドにはソマリア系のイッサ族とエチオピア
系のアファル族の対立があり、独立問題は複雑でフランスの海外県にとどまっていた。
1967年、住民投票によって引き続きフランス領であることを選択したあと、
フランス領アファル・イッサと改称された。その後、議会選挙でアファル族の進
歩党が圧勝。また、イッサ族を基盤とする独立アフリカ人民同盟も勢力をのばし独立を要求した。
1977年、ジブチ共和国として独立し、イッサ族出身のグレドが大統領に就任した。
しかし、部族対立はおさまらず、1991年内戦が勃発。グレド大統領は脱部族政策を打ち出
すとともに大統領の直接選挙制をも導入し、1993年に4選された。
その後、グレド大統領の後継ゲレが1999年に大統領に当選、2001年に内戦が終結した。
国境を巡って隣国エリトリアと対立しており、1990年には二度の軍事衝突が起きている。
停戦が成立したが、国境線を巡る緊張は続いた。2008年6月10日、ジブチ・エリトリア国境紛争で再び両軍の間で戦闘が起きた。
ジプチ政府はエリトリアが再び国境線に軍を増強しているとして非難し、国際社会の介入を求めた。
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