1903年（明治36年）に山陽鉄道が「宮島渡航株式会社」を買収し、鉄道連絡船になる。
1906年（明治39年）12月1日、山陽鉄道が国有化され、国鉄航路になる。
1987年（昭和62年）4月1日、 国鉄分割民営化に伴い、西日本旅客鉄道（JR西日本）に移管される。
2009年（平成21年）2月2日、西日本旅客鉄道（JR西日本）の子会社・JR西日本宮島フェリー株式会社が設立され航路を引き継ぐ。