| ストーリー・ダイジェスト（各章のあらすじ） | ||
| 第①章 | シャカ！ 燃える死の予感 |
天闘士１３使徒の一人であるシャカのもとに、天界よりの使者で あるアポロン達が降臨！主神ゼウスによる、神々の粛清「ネオ・ ジェネシス・イーラ」が発動された事実を告げる。そして、究極の ナイン・センシズを覚醒させたシャカは、月影神ミラと対決する！ |
| 第②章 | 神に なりそこねた男！ |
瞬の前に現れた１３使徒アリオンは、一輝が天闘士のファウスト である事を明かし、瞬を拉致せんとする。だが、その場に意外な 援軍・冥界三巨頭が登場！ザコ共を一蹴し、アリオンに挑むのだが…。そして、弟たちのピンチに出現した一輝が選ぶ道とは？ |
| 第③章 | アテナ！ 決意の瞬間… |
父帝ゼウスとの聖戦を前に心揺れるアテナ…。そして、その前に 現れた至高の来訪者・天帝ア＝ヴェル！アテナの実兄である彼 は、天界との戦いを決意するなら、まず自分の屍を越えていけと 迫る。果たしてアテナが下す決断とは？序章編クライマックス！ |
| 第④章 | さらば！ 黄金の戦士たち （前編） |
ネオ・ジェネシス・イーラ発動により、世界中で未曾有の異変が 勃発し、聖闘士抹殺の使命を帯びた１３使徒も次々降臨。老師 の前にはアンタレスが、そして１２宮には４７士とスパルタスが… さらにムウたち黄金の前には、天衣をまとったシャカが現れる！ |
| 第⑤章 | さらば！ 黄金の戦士たち （後編） |
圧倒的な力を見せる天闘士軍の前に苦戦する聖闘士軍。だが、 そこにオルフェやソレント、そして復帰した星矢達も参戦し、戦い は激化していく！一方、叛徒と化したシャカは、アイオリアやミロ をも退け、ついにアテナと対峙するが、その真相や如何に…？ |
| 第⑥章 | 天上編 （前編） |
地上での決戦に辛くも勝利したアテナと星矢達は、神々の本拠・ 天上界へ出陣する。そして、それを待ち受ける天界４神帝！彼ら が導き示す答とは、果たして希望か絶望か？海楼域を守護する トリトンに立ち向かう氷河…そして、海皇の小宇宙が交錯する！ |
| 第⑦章 | 天上編 （中編） |
４神帝との激戦の中、瞬は冥蓬域の守神テ＝レスと対決！ハー デスの助力もあり、神々の陰謀の片鱗を知るところとなる。一輝 も参戦した闘いの行方は？そして、最後の日輪門で待ち受ける 最強の男アポロン！シャカをも倒す、この男を攻略できるのか？ |
| 第⑧章 | 天上編 （後編） |
アポロンに苦戦する星矢ら青銅５は、遂に神聖衣をまとい、形勢 を逆転かに見えたが、アポロンには、さらなる究極の切り札が！ 紫龍決死の奥義は起死回生の一手となるか？そして、アテナは 女帝ヘラとの決戦に臨み、神々の王も決戦の場に姿を現した！ |
| 最終章 | 星の少年達よ！ 永遠に… |
世界中が無残に崩壊していく中、刻一刻と最後の瞬間が迫る。 この状況を打破すべく、大神ゼウスに果敢に立ち向かう星矢！ だが、その大いなる小宇宙が語りかける真なる敵の正体とは？ 今、オリュンポスを揺るがして、運命の英雄たちが飛翔する…！ |
| メイン・キャラクターの紹介（オリジナル・キャラクター） | |||||||
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大神・ゼウス オリュンポス12神の主神。全世界 を粛清、理想郷に転生させるべく ネオ・ジェネシス・イーラを発動！ |
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女帝・ヘラ ゼウスをサポートする３人の天妃 を束ねる。これまでの神々の聖戦 を影から操っていたとの噂も…？ |
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天帝・ア＝ヴェル 主神ゼウスの嫡男にして、アテナ の実兄。４神帝の一人でもある。 今後の聖戦の行方の鍵を握る。 |
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三天妃・ミネルディア 直属の部下である、天闘士ロゼ （魔鈴）を地上界に派遣するなど、 独自の行動をとる、愛の女神。 |
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三天妃・アルテミス ゼウスに仕える、３天妃の一人。 知恵と美を司り、聖戦に隠された 黙示録の真実を継承する女神。 |
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四神帝・アポロン １３使徒の将にして、天闘士最強 を誇る男。天上界への入口である 日輪門を守護し、星矢達と戦う！ |
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四神帝・テ＝レス 神々の墓場・冥蓬域を守護する。 かつてハーデスの密偵だったが、 ゼウスに心酔し、天界に与する。 |
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四神帝・トリトン 天上の聖海・海楼域を守護する。 本来は、ポセイドン配下の海闘士 （シードラゴン）であったらしい…？ |
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１３使徒・ミラ 天闘士１３使徒・第１の刺客として 天界の逆賊となったシャカと闘う。 必殺技は、ムーン・レス・ナイト！ |
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１３使徒・アリオン 天闘士１３使徒の一人。ファウスト （一輝）を天上の同志として迎えに 現れ、瞬や冥界・三巨頭と対決！ |
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| オリジナル設定＆用語解説 | |
| Ｎ・Ｇ・Ｅ （ネオ・ジェネシス・イーラ） |
主神ゼウスだけが発動できる、大いなる意思（ビッグ・ウィルズ） によって世界を一度無に還し、新たな理想郷として転生させると いう儀式。地上や海界はもとより、天界以外の全てが滅びる！ |
| ナイン・センシズ | セブン、エイトを超える、究極の小宇宙に目覚めるための感覚。 「神の芽」とも言われ、神に匹敵する力を得るための鍵となる。 |
| 天闘士 （エンペラー） |
ナイン・センシズに目覚め、地上や海界から昇天した人間達に 与えられる戦士の称号。特に、最初に昇天した１３人を、最強の １３使徒と呼ぶ。彼らが纏うのは、究極の天衣（ド・レス）である。 |
| 天上界 （ロイヤルス・ヘヴーン） |
主神・ゼウスが治める天界。神々の故郷・オリュンポスがあり、 人間がここまで辿り着くには、天空域や海楼域、冥蓬域などの 天界・４神帝が守護を担当する各聖域を突破する必要がある。 |
