ボストンの Dana-Farber Cancer Institute にある私の病理学・腫瘍学・疫学の研究室で
やる気のあるポスドクあるいは研究技師(ボランティア)を募集しています
。
データが長年にわたってすでに蓄積されていますので、ポスドクの方にはやる気しだいで
1年以内に論文を書いていただけますし、Contributionにより複数の論文の共著者になる
ことも可能です。研究技師の方でも、Contributionにより複数の論文の共著者になることも
可能です。
同じラボに日本人が5人働いていますので、英語の苦手な人でもコミュニケーションの問題
がありません。英語にもすぐに慣れます。ポスドクのcandidateでしたら、
病理学や腫瘍学あるいは消化器科学の研究(あるいは病理診断)の経験があると強
みです。研究技師のcandidateでしたら、いろいろな学歴や職場経験がありえますが、
それらをすべて考慮いたします。
主な仕事はパラフィン癌組織サンプルの管理とプロセシング、データーベースの
管理、免疫組織染色、DNA解析、統計解析、プログラミングです。統計解析とプログ
ラミングについては、経験のない方にはきちんと指導いたします。
プロジェクトは大腸癌、線腫、膵臓癌の分子病理疫学です。私のラボでは大規模
な前向き疫学コホートを使って大腸癌と膵臓癌の様々な分子異常の疫学的病因を研究
しています。ハーバード大学公衆衛生大学院とBrigham and Women’s Hospitalではこ
れ
まで当初は健康な12万人の女性を30年(Nurses' Health Study
)、5万人の男性を20年(Health
Professionals Follow-up Study)追跡し
て、
病気の発生を疫学的に研究してきました。
私のラボではこの2つの大規模コホー
トにおいて追跡中に発生した大腸癌と膵臓癌の癌細胞内の遺伝子の異常、Epigenetic
changes (DNAメチル化)、酵素やその他のたんぱく質発現の変化を解析しています
。追跡に先立ち、あるいは20年、30年という追跡中に、食べ物、ライフスタイ
ル(運動・肥満度・たばこ・アルコールなど)、薬、家族歴、癌や他の病気の発生
、生存状況を記録しています。こうした病因に関するデータは癌の発生に先立って集
められているためにバイアスのリスクがより少ないのが、前向きコホート研究の長所
です。こうして蓄積された貴重な病因データ、さまざまな遺伝子の多形(SNPs)
、癌細胞の分子異常、患者の生存状況とを詳細かつ総合的に分析するというのが私
のラボの研究内容です。
一例としてアスピリンがCOX-2高発現の大腸癌の発生をふせぐ
という病理疫学データを発表しています(New Engl J Med 2007)。これまでこれら
のコホート研究はUS National Institute of Health(NIH)より研究費をとり続けて
います。その他、Multicenter Collaborative ProjectであるCancer and Leukemia
Group B (CALGB)のメンバーとして、大腸癌の
Biomarkerを調べています。
論文のリストがUpdateされていないのですが、プロジェクトの様子などは下のリ
ンクでごらんください。2008年以降の論文のリストは下にペーストしておきます。
興味のある方は(sogi43@gmail.com)宛てに直接連絡をお願いします。興味のあ
りそうな人をご存知の方は、この情報をパスして頂きますと幸いです。お問い合わせ
や応募が多い場合は返答しきれないこともあるかとございますが、どうかご容赦くだ
さい。
荻野周史
Shuji Ogino, M.D., Ph.D.
Associate Professor of Pathology, Harvard Medical School Department of
Pathology, Brigham and Women's Hospital Department of Medical Oncology,
Dana-Farber Cancer Institute
リンク 1、
リンク 2、
リンク 3
Recent original publications (2008-2009)
Nosho K, Shima K, Irahara N, Kure S, Baba Y, Kirkner GJ, Chen L, Gokhale S,
Hazra A, Spiegelman D, Giovannucci EL, Jaenisch R, Fuchs CS, Ogino S.* DNA
methyltransferase-3B (DNMT3B) expression may contribute to CpG island
methylator phenotype in colorectal cancer. Clin Cancer Res 2009: in press.
Ogino S,* Nosho K, Kirkner GJ, Shima K, Irahara N, Kure S, Chan AT,
Engelman
JA, Kraft P, Cantley LC, Giovannucci EL, Fuchs CS. PIK3CA mutation is
associated with poor prognosis among patients with curatively resected
colon
cancer. J Clin Oncol 2009: In press.
Ogino S,* Shima K, Baba Y, Nosho K, Irahara N, Kure S, Chen L, Toyoda S,
Kirkner GJ, Wang YL, Giovannucci EL, Fuchs CS. Colorectal cancer
expression
of PPARG (peroxisome proliferator-activated receptor-gamma) is associated
with good prognosisis. Gastroenterology 2009: In press.
Ogino S,* Nosho K, Kirkner GJ, Kawasaki T, Meyerhardt JA, Loda M,
Giovannucci EL, Fuchs CS. CpG island methylator phenotype, microsatellite
instability, BRAF mutation and clinical outcome in colon cancer. Gut
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Nosho K, Shima K, Kure S, Irahara N, Baba Y, Chen L, Kirkner GJ, Fuchs CS,
Ogino S.* JC virus T-antigen in colorectal cancer Is associated with p53
expression and chromosomal instability, independent of CpG island
methylator
phenotype. Neoplasia 2009;11:87-95.
Nosho K, Irahara N, Shima K, Kure S, Kirkner GJ, Schernhammer ES, Hazra A,
Hunter DJ, Quackenbush J, Spiegelman D, Giovannucci EL, Fuchs CS, Ogino S.*
Comprehensive biostatistical analysis of CpG island methylator phenotype in
colorectal cancer using a large population-based sample. PLoS ONE
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Ogino S,* Nosho K, Kirkner GJ, Kawasaki T, Chan AT, Schernhammer ES,
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Jain S, Bojarski E, Barretina J, Chan JA, Baselga J, Tabernero J, Root DE,
Fuchs C, Loda M, Shivdasani RA, Meyerson M, Hahn WC. CDK8 is a colorectal
cancer oncogene that regulates b-catenin. Nature 2008;455:547-551.
Ogino S,* Kirkner GJ, Nosho K, Irahara N, Kure S, Shima K, Hazra A, Chan
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Dehari R, Giovannucci EL, Fuchs CS. Cyclooxygenase-2 expression is an
independent predictor of poor prognosis in colon cancer. Clin Cancer Res
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Nosho K, Kawasaki T, Ohnishi M, Suemoto Y, Kirkner GJ, Zepf D, Yan L,
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Kawasaki T, Ohnishi M, Nosho K, Suemoto Y, Kirkner GJ, Meyerhardt JA, Fuchs
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cancer shows not only few methylated CIMP-high-specific CpG islands, but
also low-level methylation at individual loci. Mod Pathol 2008; 21:
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Kawasaki T, Nosho K, Ohnishi M, Suemoto Y, Glickman JN, Chan AT, Kirkner
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Mino-Kenudson M, Fuchs CS, Ogino S.* Cyclooxygenase-2 overexpression is
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hyperplastic polyp and sessile serrated polyp/adenoma. BMC Cancer 2008; 8:
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Ogino S,* Kawasaki T, Nosho K, Ohnishi M, Suemoto Y, Kirkner GJ, Fuchs CS.
LINE-1 hypomethylation is inversely associated with microsatellite
instability and CpG island methylator phenotype in colorectal cancer. Int
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Firestein R, Blander G, Michan S, Oberdoerffer P, Ogino S, Campbell J,
Bhimavarapu A, Luikenhuis S, de Cabo R, Fuchs C, Hahn WC, Guarente LP,
Sinclair DA. The SIRT1 deacetylase suppresses intestinal tumorigenesis and
colon cancer growth. PLoS ONE 2008; 3: e2020.
Nosho K, Kawasaki T, Chan AT, Ohnishi M, Suemoto Y, Kirkner GJ, Fuchs CS,
Ogino S.* Cyclin D1 is frequently overexpressed in microsatellite unstable
colorectal cancer, independent of CpG island methylator phenotype.
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Schernhammer ES, Giovannucci EL, Fuchs CS, Ogino S. A prospective study of
dietary folate and vitamin B and colon cancer according to MSI and KRAS
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