感染（ウィルス、細菌）や食物アレルギーなど、特別な原因がないにもかかわらず、慢性的に腸の炎症や潰瘍を生じる病気を非特異炎症性腸疾患といいます。なかでも代表的なのが、潰瘍性大腸炎とクローン病です。
かつては比較的稀な病気とされていましたが近年増加の一途をたどり、現在の我が国の患者数は、潰瘍性大腸炎が約8万人、クローン病が約3万人といわれています。

いずれも働き盛りの20歳代に多い病気ですが、その原因がいまだ解明されてはいないために根本治療はできず、主に薬剤や経腸栄養などの内科的治療により緩解状態（炎症が落ち着いた状態）の維持が行われます。
しかしながら、両疾患ともに、炎症のコントロールが難しい場合や、内科的治療ができない合併症を生じた場合には手術による治療が必要となります。

潰瘍性大腸炎は、直腸からS状結腸、原因不明の炎症、潰瘍を生ずる病気です。
病変は、時に全大腸に及びますが、小腸に病変を生ずることはほとんどありません。
症状としては、下痢、下血がみられることが多いですが、炎症が高度となった場合、発熱や腹痛を生ずることもあります。
治療は内科的治療が中心となり、アミノサリチル酸製剤、ステロイド、免疫抑制剤による薬物治療や、白血球除去療法などが行われます。
しかし、厳重な内科的治療でも炎症をコントロールできない重症の方や、炎症のコントロールはできるが再燃しやすく、ステロイド等の薬剤の副作用が問題となる難治性の方に対して手術が必要となります。
大腸癌を合併した場合も手術が必要となります。

潰瘍性大腸炎に対する手術は大腸全摘術を行うのが原則です。
大腸を全摘し、自然肛門を温存して小腸と肛門をつなぐ手術を行っています。
手術は2ないし3回に分けて行う必要があり、一時的に人工肛門を造ることになりますが、最終的には1日あたり5−7回の自然肛門からの排便で生活出来るようになる方が多くを占めます。
初回手術から最後の手術までの必要期間は約4ヶ月－1年です。
潰瘍性大腸炎では大腸にしか炎症が起きませんので、大腸全摘によって薬物による内科的治療が不要となります。

クローン病は主に小腸や大腸に原因不明の潰瘍を生じる病気で、症状としては腹痛、発熱、下痢、体重減少などがみられます。
治療は潰瘍性大腸炎と同様に内科的治療が中心となり、アミノサリチル酸製剤、ステロイド、免疫抑制剤、分子標的製剤(レミケード)による炎症のコントロールが行われます。
また、クローン病の炎症のコントロールには絶食が有効であることが知られており、経腸栄養や中心静脈栄養といった栄養療法が治療として行われています。しかしこうした治療を行っている間に、腸閉塞や穿孔による腹膜炎、膿瘍などの合併症を生じた場合には手術を行う必要があります。

外科手術の目的は、合併症の治療をして食事摂取を可能とすることであり、基本的には必要最小限の腸切除術、あるいは小腸狭窄形成術（狭くなったところを広げる手術）が行われます。
また、クローン病の方の3-4割に肛門部病変を合併することが知られていますが、特に肛門周囲膿瘍や痔瘻を合併した場合は、切開排膿手術、シートン挿入術（膿がたまりにくくするための管を肛門部に挿入する手術）などの外科手術が必要になります。
なお、以上のような外科治療を行った後も、引き続き内科的治療による炎症のコントロールが必要となります。

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