特発性間質性肺炎（IIPs）

• 特発性肺線維症（IPF）
• 急性間質性肺炎（AIP）
• 非特異性間質性肺炎（NSIP）
• 特発性器質化肺炎（COP）
• リンパ球性間質性肺炎（LIP）
• 剥離性間質性肺炎（DIP）
• 呼吸細気管支/間質性肺炎（RB-ILD）

その他の原因不明疾患

• 慢性好酸球性肺炎（CEP）
• 急性好酸球性肺炎（AEP）
• リンパ脈管筋腫症（LAM）
• 肺胞たんぱく症　alveolar proteinosis
• Hermansky-Pudlak症候群
• Langerhans細胞肉芽腫症
• ヘモジデローシス
• 肺胞微石症

肉芽腫性疾患

• サルコイドーシス

職業性肺疾患

• 珪肺症
• 石綿肺
• 慢性ベリリウム症
• シデローシス
• アルミニウム肺
• 超合金肺（GIP）

環境誘発性疾患

• 過敏性肺炎

膠原病および関連疾患

• 関節リウマチ（RA）
  皮膚筋炎/多発性筋炎（PM/DM）
  全身性エリトマトーデス（SLE)
  強皮症（全身性硬化症）（PSS）
  混合性結合組織病（MCTD）
  Sjogren症候群
  Behcet病
  Wegener肉芽腫症（WG）
  結節性多発動脈炎（PN）
  顕微鏡的多発動脈炎（microscopic PN）
  Churg-Strauss症候群

薬剤誘起性肺疾患

• 抗生物質・抗菌薬
• ニトロフラントイン
• 抗不整脈薬
• （アミオダロン）
• 消炎薬
• 金製剤
• ペニシラミン
• インターフェロン
• 小柴胡湯
• 抗腫瘍薬
• ゲフィチニブ（イレッサ）
• レフルノミド（アラバ）
• メトトレキサート
• パラコート
• 放射線

腫瘍性肺疾患

• 細気管支肺胞上皮癌（BAC)
• 癌性リンパ管症
• 癌血行性肺転移
• 悪性リンパ腫
• リンパ腫様肉芽腫症（LG）
• Kaposi肉腫

感染性肺疾患

• 細菌性肺炎
• ウイルス性肺疾患
• カリニ肺炎
• クラミジア肺炎
• マイコプラズマ肺炎
• 粟粒結核
• 真菌性肺炎

気道系が関与する肺疾患

• びまん性汎細気管支炎（DPB）
• immotile cilia症候群
• 嚢胞性線維症cystic fibrosis

その他のびまん性肺疾患

• 高地肺水腫
• HIV合併びまん性肺病変
• HTLV-1感染合併肺病変